“美丽化学”起始于中国科学技术大学先进技术研究院和清华大学出版社联合制作的原创科学传播项目，其主旨是将化学的美丽和神奇传递给大众。目前美丽化学由美丽科学和中国科学技术大学共同维护更新。
美丽化学网站第一版的英文版于2014年9月30日上线，中文版于2014年10月31日上线。在第一版中，我们使用4K高清摄影机捕捉化学反应中的缤纷色彩和微妙细节；在分子尺度上，我们使用先进的三维电脑动画和互动技术，展示近年来在《自然》和《科学》等国际知名期刊中报道的微观化学结构。截止2015年5月底，有超过25万人访问美丽化学网站（其中美国用户占24％，中国用户占23%），网站页面点击量超过500万，在线视频播放次数超过450万。
美丽化学网站第二版的英文版于2015年12月31日上线。在新版本中我们增加了化学史内容。例如我们用世界一流的电脑图像还原了1660－1860年间波义耳、普利斯特里、拉瓦锡等12位著名的化学家的十五套重要的化学反应装置。在“化学结构”模块，除了增加了新的化学结构，我们也采用了全新的图像渲染形式，更生动的展示化学结构。在网站的设计上，新版本采用了简洁明快的设计以突出内容本身，而且也增加了响应式设计，为用户在移动设备上带来更好的体验。
100多年前，德国著名生物学家恩斯特·海克尔（Ernst Haeckel）出版了《自然界的艺术形态》。他用精美的、具有新艺术运动风格的插画描绘自然界中不为人知的生命形态，深受当时大众的喜爱。我们希望美丽化学能够追寻海克尔的足迹，用数字媒体和技术展示化学世界中丰富多彩的结构和变化。我们希望形成一种独特的化学审美观，使化学的美能够被更多人了解，从而让更多的孩子和学生对化学产生兴趣。
制作团队
成果
获得奖项
2015年2月获得由美国国家科学基金会（NSF）和美国《大众科学》杂志（Popular Science）举办的Vizzies国际科学可视化竞赛视频类专家奖 (Experts' Choice)
2015年4月获得由浙江省科技馆和果壳网举办的菠萝科学奖菠萝U奖
2015年5月获得由上海科技馆举办的上海科普微电影大赛最佳摄影奖
2015年7月获得第六届中国数字出版博览会2014-2015年度创新作品奖
2016年4月获得由上海浦东新区科委科协主办的第三届中国浦东科普微电影大赛最佳创意奖
参加展览
2014年12月，中国电脑美术20年，中华世纪坛，北京
2015年7月，自然与艺术之谜特展，台湾国立自然科学博物馆
2015年8月，上海国际科学与艺术展，中华艺术宫，上海
2015年9月，英国皇家摄影学会国际科学图像展（International Images for Science），英国巡展
2016年3月，西班牙巴塞罗那科技馆，视频墙
2016年4月，美国西雅图太平洋科学中心，化学主题展览
授权情况
2014年10月7日，加拿大探索频道《每日星球》（Daily Planet）栏目对"美丽化学"项目进行报道。
2015年3月，美丽化学中的一段视频被跨界的电影《对称》（Symmetry）采用。《对称》是在欧洲核子物理研究所（CERN）中以宏伟的粒子对撞机为背景拍摄的一部歌舞剧。
2015年3月，授权RED BEARD品牌在梅赛德斯－奔驰时装周（伊斯坦布尔站）上使用"美丽化学"视频，用于T型台背景视频。
2015年3月11日，美丽化学视频出现在BBC 《新闻之夜》（Newsnight）节目中，用来比喻英国当前的联合政府。
2015年4月22日，美丽化学视频出现在由2013年诺贝尔和平奖得主“禁止化学武器组织（OPCW）”为化学武器第一次大规模使用100周年制作的纪录片《牢记伊普尔》（Remembering Ieper）中。
2015年11月8日，美丽化学视频出现在2015腾讯WE大会的开场视频中，表现大会 “向未来，共生长” 的主题。包括LinkedIn联合创始人Reid Hoffman和MIT媒体实验室总监Joi Ito等重量级人物都在这次盛会上发表了精彩演讲。
其它授权包括MIT慕课课程，哥伦比亚大学化学系主页，剑桥大学出版社，HTC等。